MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 3151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002682	GCC	2	6	169454	169459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488541
2502	NC_002682	TCG	2	6	169503	169508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488541
2503	NC_002682	GATC	2	8	169526	169533	25 %	25 %	25 %	25 %	13488541
2504	NC_002682	TC	3	6	169563	169568	0 %	50 %	0 %	50 %	13488541
2505	NC_002682	GCCTTC	2	12	169581	169592	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488541
2506	NC_002682	CAT	3	9	169619	169627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488541
2507	NC_002682	CGT	2	6	169655	169660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488541
2508	NC_002682	GCCG	2	8	169661	169668	0 %	0 %	50 %	50 %	13488541
2509	NC_002682	CGG	2	6	169802	169807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488542
2510	NC_002682	CGA	2	6	169823	169828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2511	NC_002682	CTG	2	6	169952	169957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2512	NC_002682	CCA	2	6	170035	170040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488542
2513	NC_002682	GCGA	2	8	170055	170062	25 %	0 %	50 %	25 %	13488542
2514	NC_002682	CGA	2	6	170074	170079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2515	NC_002682	CGAT	2	8	170107	170114	25 %	25 %	25 %	25 %	13488542
2516	NC_002682	TCG	2	6	170145	170150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2517	NC_002682	GC	4	8	170154	170161	0 %	0 %	50 %	50 %	13488542
2518	NC_002682	TGC	3	9	170196	170204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2519	NC_002682	AGGA	2	8	170205	170212	50 %	0 %	50 %	0 %	13488542
2520	NC_002682	TTG	2	6	170298	170303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488542
2521	NC_002682	GGCC	2	8	170324	170331	0 %	0 %	50 %	50 %	13488542
2522	NC_002682	CGTGG	2	10	170332	170341	0 %	20 %	60 %	20 %	13488542
2523	NC_002682	TGA	2	6	170344	170349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488542
2524	NC_002682	TGT	2	6	170401	170406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488542
2525	NC_002682	ATC	2	6	170460	170465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488542
2526	NC_002682	TCG	2	6	170473	170478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2527	NC_002682	GT	3	6	170556	170561	0 %	50 %	50 %	0 %	13488542
2528	NC_002682	GGC	2	6	170616	170621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488542
2529	NC_002682	GCA	2	6	170709	170714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488542
2530	NC_002682	CGC	2	6	170719	170724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488542
2531	NC_002682	GCG	3	9	170727	170735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488542
2532	NC_002682	CCG	2	6	170736	170741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488542
2533	NC_002682	CGAC	2	8	170785	170792	25 %	0 %	25 %	50 %	13488542
2534	NC_002682	GAT	2	6	170819	170824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488542
2535	NC_002682	GCA	2	6	171047	171052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488543
2536	NC_002682	GTC	2	6	171084	171089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488543
2537	NC_002682	CG	3	6	171131	171136	0 %	0 %	50 %	50 %	13488543
2538	NC_002682	GCCG	2	8	171139	171146	0 %	0 %	50 %	50 %	13488543
2539	NC_002682	CGA	2	6	171155	171160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488543
2540	NC_002682	CTC	2	6	171267	171272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488543
2541	NC_002682	CGCA	2	8	171273	171280	25 %	0 %	25 %	50 %	13488543
2542	NC_002682	TGG	2	6	171484	171489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488544
2543	NC_002682	GGA	2	6	171506	171511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488544
2544	NC_002682	TCAAGA	2	12	171523	171534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13488544
2545	NC_002682	GC	3	6	171550	171555	0 %	0 %	50 %	50 %	13488544
2546	NC_002682	GC	3	6	171567	171572	0 %	0 %	50 %	50 %	13488544
2547	NC_002682	ATC	2	6	171603	171608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488544
2548	NC_002682	CGAGGG	2	12	171626	171637	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13488544
2549	NC_002682	GAA	2	6	171785	171790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488544
2550	NC_002682	ATG	2	6	171865	171870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488544
2551	NC_002682	GTCG	2	8	172031	172038	0 %	25 %	50 %	25 %	13488544
2552	NC_002682	CG	3	6	172103	172108	0 %	0 %	50 %	50 %	13488545
2553	NC_002682	CGG	2	6	172137	172142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488545
2554	NC_002682	GCTCT	2	10	172149	172158	0 %	40 %	20 %	40 %	13488545
2555	NC_002682	AGCC	2	8	172170	172177	25 %	0 %	25 %	50 %	13488545
2556	NC_002682	ATC	2	6	172187	172192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488545
2557	NC_002682	CAG	2	6	172229	172234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488545
2558	NC_002682	CAG	2	6	172237	172242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488545
2559	NC_002682	CG	3	6	172286	172291	0 %	0 %	50 %	50 %	13488545
2560	NC_002682	GC	3	6	172308	172313	0 %	0 %	50 %	50 %	13488545
2561	NC_002682	GCCC	2	8	172328	172335	0 %	0 %	25 %	75 %	13488545
2562	NC_002682	ATT	2	6	172352	172357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488545
2563	NC_002682	GCG	2	6	172381	172386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488545
2564	NC_002682	GTTC	2	8	172503	172510	0 %	50 %	25 %	25 %	13488545
2565	NC_002682	CAG	2	6	172547	172552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488545
2566	NC_002682	GCC	2	6	172602	172607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488545
2567	NC_002682	TTC	2	6	172759	172764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488546
2568	NC_002682	GCC	2	6	172796	172801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488546
2569	NC_002682	AT	3	6	172802	172807	50 %	50 %	0 %	0 %	13488546
2570	NC_002682	CTCGCG	2	12	172829	172840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488546
2571	NC_002682	CCA	2	6	172859	172864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488546
2572	NC_002682	CGG	2	6	172894	172899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488546
2573	NC_002682	CTG	2	6	172907	172912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2574	NC_002682	CGA	2	6	172933	172938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2575	NC_002682	CGG	2	6	172939	172944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488546
2576	NC_002682	CG	3	6	172964	172969	0 %	0 %	50 %	50 %	13488546
2577	NC_002682	TTC	2	6	172988	172993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488546
2578	NC_002682	AGC	2	6	173025	173030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2579	NC_002682	GCA	2	6	173048	173053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2580	NC_002682	CGA	2	6	173064	173069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2581	NC_002682	ATC	2	6	173081	173086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488546
2582	NC_002682	TGC	3	9	173139	173147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2583	NC_002682	GCT	2	6	173155	173160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2584	NC_002682	GTC	2	6	173165	173170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2585	NC_002682	CGC	2	6	173200	173205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488546
2586	NC_002682	TCTTGC	2	12	173223	173234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13488546
2587	NC_002682	ACA	3	9	173283	173291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488546
2588	NC_002682	TCG	2	6	173297	173302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2589	NC_002682	GCCG	2	8	173312	173319	0 %	0 %	50 %	50 %	13488546
2590	NC_002682	CGG	2	6	173332	173337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488546
2591	NC_002682	TCCT	2	8	173408	173415	0 %	50 %	0 %	50 %	13488546
2592	NC_002682	GGT	2	6	173446	173451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488546
2593	NC_002682	GTTCG	2	10	173455	173464	0 %	40 %	40 %	20 %	13488546
2594	NC_002682	GCT	2	6	173473	173478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488546
2595	NC_002682	AAG	2	6	173480	173485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488546
2596	NC_002682	CGCC	2	8	173490	173497	0 %	0 %	25 %	75 %	13488546
2597	NC_002682	ACC	2	6	173579	173584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488546
2598	NC_002682	GCCT	2	8	173618	173625	0 %	25 %	25 %	50 %	13488546
2599	NC_002682	AGG	2	6	173655	173660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488546
2600	NC_002682	CCA	2	6	173678	173683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488546
2601	NC_002682	GCG	2	6	173693	173698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488546
2602	NC_002682	GTC	2	6	173722	173727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488547
2603	NC_002682	GCAG	2	8	173772	173779	25 %	0 %	50 %	25 %	13488547
2604	NC_002682	CGA	2	6	173844	173849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488547
2605	NC_002682	CGA	2	6	173856	173861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488547
2606	NC_002682	ACA	2	6	173930	173935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488547
2607	NC_002682	CGA	2	6	174060	174065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488547
2608	NC_002682	CAT	2	6	174078	174083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488547
2609	NC_002682	GC	3	6	174117	174122	0 %	0 %	50 %	50 %	13488547
2610	NC_002682	CGA	2	6	174165	174170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488547
2611	NC_002682	AGGA	2	8	174227	174234	50 %	0 %	50 %	0 %	13488547
2612	NC_002682	ACC	2	6	174235	174240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488547
2613	NC_002682	GC	3	6	174311	174316	0 %	0 %	50 %	50 %	13488547
2614	NC_002682	GCGG	2	8	174333	174340	0 %	0 %	75 %	25 %	13488547
2615	NC_002682	CCG	2	6	174404	174409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488547
2616	NC_002682	GGC	2	6	174414	174419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488547
2617	NC_002682	CGTCCT	2	12	174435	174446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488547
2618	NC_002682	GTC	2	6	174469	174474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488547
2619	NC_002682	TTTGC	2	10	174490	174499	0 %	60 %	20 %	20 %	13488547
2620	NC_002682	GGT	2	6	174933	174938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488548
2621	NC_002682	ATC	2	6	175006	175011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488548
2622	NC_002682	CGA	2	6	175044	175049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488548
2623	NC_002682	ATG	2	6	175158	175163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488549
2624	NC_002682	CTG	2	6	175174	175179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488549
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2743	NC_002682	GAAT	2	8	182387	182394	50 %	25 %	25 %	0 %	13488553
2744	NC_002682	ACG	2	6	182474	182479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488553
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2746	NC_002682	CGC	2	6	182671	182676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488554
2747	NC_002682	GCG	2	6	182731	182736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488554
2748	NC_002682	GAT	2	6	182802	182807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488554
2749	NC_002682	GTC	2	6	182880	182885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488554
2750	NC_002682	CGC	2	6	182912	182917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488554
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2787	NC_002682	CG	3	6	185205	185210	0 %	0 %	50 %	50 %	13488556
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2865	NC_002682	CGG	2	6	190711	190716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488562
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2992	NC_002682	G	6	6	199509	199514	0 %	0 %	100 %	0 %	13488572
2993	NC_002682	GGCAG	2	10	199548	199557	20 %	0 %	60 %	20 %	13488572
2994	NC_002682	GC	3	6	199642	199647	0 %	0 %	50 %	50 %	13488572
2995	NC_002682	CG	3	6	199690	199695	0 %	0 %	50 %	50 %	13488572
2996	NC_002682	ACG	2	6	199696	199701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488572
2997	NC_002682	CGA	2	6	199730	199735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488572
2998	NC_002682	CAT	2	6	199779	199784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488572
2999	NC_002682	GCC	2	6	199812	199817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488572
3000	NC_002682	GGCCG	2	10	199950	199959	0 %	0 %	60 %	40 %	13488572

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